MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 3889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007763	GTC	2	6	349	354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359882
2	NC_007763	GCA	2	6	449	454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359882
3	NC_007763	CGA	2	6	549	554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359882
4	NC_007763	TCG	2	6	596	601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359882
5	NC_007763	CAAT	2	8	621	628	50 %	25 %	0 %	25 %	86359882
6	NC_007763	TGATC	2	10	630	639	20 %	40 %	20 %	20 %	86359882
7	NC_007763	CTG	2	6	670	675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359882
8	NC_007763	TGA	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359882
9	NC_007763	TGC	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
10	NC_007763	TGG	2	6	1085	1090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359883
11	NC_007763	CTGG	2	8	1116	1123	0 %	25 %	50 %	25 %	86359883
12	NC_007763	CTG	3	9	1378	1386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
13	NC_007763	GGC	2	6	1502	1507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359883
14	NC_007763	GTC	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
15	NC_007763	GAT	3	9	1561	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359883
16	NC_007763	CAT	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359883
17	NC_007763	CTT	2	6	1663	1668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359883
18	NC_007763	GCT	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
19	NC_007763	CAA	2	6	1875	1880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359883
20	NC_007763	GGT	2	6	1881	1886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359883
21	NC_007763	CGG	2	6	1902	1907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359883
22	NC_007763	CGG	2	6	1914	1919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359883
23	NC_007763	GCC	2	6	1928	1933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359883
24	NC_007763	CCTCAT	2	12	1959	1970	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	86359883
25	NC_007763	TCCG	2	8	2071	2078	0 %	25 %	25 %	50 %	86359883
26	NC_007763	GGC	2	6	2114	2119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359883
27	NC_007763	CGC	3	9	2136	2144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359883
28	NC_007763	TCG	2	6	2162	2167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
29	NC_007763	AAAT	2	8	2232	2239	75 %	25 %	0 %	0 %	86359883
30	NC_007763	CGA	2	6	2288	2293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359883
31	NC_007763	TGC	2	6	2330	2335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
32	NC_007763	TCC	2	6	2413	2418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359883
33	NC_007763	CGT	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
34	NC_007763	GCA	2	6	2442	2447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359883
35	NC_007763	AAGG	2	8	2452	2459	50 %	0 %	50 %	0 %	86359883
36	NC_007763	GGCG	2	8	2538	2545	0 %	0 %	75 %	25 %	86359883
37	NC_007763	GCG	2	6	2558	2563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359883
38	NC_007763	GAA	2	6	2719	2724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359883
39	NC_007763	CTG	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
40	NC_007763	GC	3	6	2776	2781	0 %	0 %	50 %	50 %	86359883
41	NC_007763	GAA	2	6	2811	2816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359883
42	NC_007763	CGT	2	6	2834	2839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359883
43	NC_007763	GC	4	8	2863	2870	0 %	0 %	50 %	50 %	86359883
44	NC_007763	GCT	2	6	3123	3128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359884
45	NC_007763	AG	3	6	3137	3142	50 %	0 %	50 %	0 %	86359884
46	NC_007763	GGCCAG	2	12	3164	3175	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86359884
47	NC_007763	AGC	3	9	3211	3219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359884
48	NC_007763	CAG	2	6	3332	3337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359884
49	NC_007763	CAG	2	6	3525	3530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359884
50	NC_007763	CCAG	2	8	3626	3633	25 %	0 %	25 %	50 %	86359884
51	NC_007763	GC	3	6	3656	3661	0 %	0 %	50 %	50 %	86359884
52	NC_007763	CGG	2	6	3671	3676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359884
53	NC_007763	CGC	2	6	3740	3745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359884
54	NC_007763	CAG	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359884
55	NC_007763	CGC	2	6	3774	3779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359884
56	NC_007763	GAAAA	2	10	3834	3843	80 %	0 %	20 %	0 %	86359884
57	NC_007763	GGC	2	6	3890	3895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359884
58	NC_007763	ATCCA	2	10	3961	3970	40 %	20 %	0 %	40 %	86359884
59	NC_007763	TTC	2	6	3972	3977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359884
60	NC_007763	ATC	2	6	4009	4014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359884
61	NC_007763	ACC	2	6	4015	4020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359884
62	NC_007763	ACC	2	6	4045	4050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359884
63	NC_007763	GAG	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359884
64	NC_007763	GATC	2	8	4195	4202	25 %	25 %	25 %	25 %	86359884
65	NC_007763	GC	3	6	4205	4210	0 %	0 %	50 %	50 %	86359884
66	NC_007763	AAT	2	6	4259	4264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86359884
67	NC_007763	CG	3	6	4971	4976	0 %	0 %	50 %	50 %	86359885
68	NC_007763	GGA	2	6	5003	5008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359885
69	NC_007763	TGCC	2	8	5069	5076	0 %	25 %	25 %	50 %	86359885
70	NC_007763	GCCT	2	8	5082	5089	0 %	25 %	25 %	50 %	86359885
71	NC_007763	TCC	2	6	5126	5131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359885
72	NC_007763	CCG	2	6	5142	5147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359885
73	NC_007763	AG	3	6	5201	5206	50 %	0 %	50 %	0 %	86359885
74	NC_007763	GTC	2	6	5224	5229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359885
75	NC_007763	CGT	2	6	5252	5257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359885
76	NC_007763	TTC	2	6	5264	5269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359885
77	NC_007763	CAC	2	6	5528	5533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359886
78	NC_007763	GCC	2	6	5585	5590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359886
79	NC_007763	GCT	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359886
80	NC_007763	GGT	2	6	5753	5758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359886
81	NC_007763	CCG	2	6	5785	5790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359886
82	NC_007763	GCC	2	6	5796	5801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359886
83	NC_007763	ATC	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359886
84	NC_007763	CGG	2	6	5994	5999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359886
85	NC_007763	GTC	2	6	6033	6038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359886
86	NC_007763	CGC	2	6	6068	6073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359886
87	NC_007763	TGC	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359886
88	NC_007763	GC	3	6	6090	6095	0 %	0 %	50 %	50 %	86359886
89	NC_007763	GAT	2	6	6101	6106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359886
90	NC_007763	CGA	2	6	6137	6142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359886
91	NC_007763	ATT	2	6	6163	6168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86359886
92	NC_007763	CTG	2	6	6170	6175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359886
93	NC_007763	GAT	2	6	6270	6275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359887
94	NC_007763	CCA	2	6	6292	6297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359887
95	NC_007763	TCGTC	2	10	6301	6310	0 %	40 %	20 %	40 %	86359887
96	NC_007763	GAC	2	6	6380	6385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359887
97	NC_007763	GCCG	2	8	6386	6393	0 %	0 %	50 %	50 %	86359887
98	NC_007763	TCGC	2	8	6395	6402	0 %	25 %	25 %	50 %	86359887
99	NC_007763	CTGGT	2	10	6405	6414	0 %	40 %	40 %	20 %	86359887
100	NC_007763	GTC	2	6	6417	6422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359887
101	NC_007763	CGC	2	6	6512	6517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359887
102	NC_007763	CGT	2	6	6554	6559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359887
103	NC_007763	GCG	2	6	6672	6677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359887
104	NC_007763	GC	3	6	6708	6713	0 %	0 %	50 %	50 %	86359887
105	NC_007763	GTC	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359887
106	NC_007763	GGA	3	9	6734	6742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359887
107	NC_007763	CAT	2	6	6761	6766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359887
108	NC_007763	CGG	2	6	6901	6906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359887
109	NC_007763	CGA	2	6	6941	6946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359887
110	NC_007763	CCG	2	6	6948	6953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359887
111	NC_007763	GAT	2	6	6993	6998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359887
112	NC_007763	TGC	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359887
113	NC_007763	GC	3	6	7070	7075	0 %	0 %	50 %	50 %	86359887
114	NC_007763	CCG	2	6	7241	7246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359887
115	NC_007763	GAA	2	6	7257	7262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359887
116	NC_007763	CGA	2	6	7301	7306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359887
117	NC_007763	CAA	2	6	7310	7315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359887
118	NC_007763	CTC	2	6	7396	7401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359887
119	NC_007763	GC	3	6	7473	7478	0 %	0 %	50 %	50 %	86359888
120	NC_007763	GCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359888
121	NC_007763	GC	3	6	7565	7570	0 %	0 %	50 %	50 %	86359888
122	NC_007763	ATC	2	6	7583	7588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359888
123	NC_007763	GGC	2	6	7609	7614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359888
124	NC_007763	CGAT	2	8	7643	7650	25 %	25 %	25 %	25 %	86359888
125	NC_007763	TCC	2	6	7667	7672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359888
126	NC_007763	GA	3	6	7777	7782	50 %	0 %	50 %	0 %	86359888
127	NC_007763	TGG	2	6	7826	7831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359888
128	NC_007763	AGCG	2	8	7843	7850	25 %	0 %	50 %	25 %	86359888
129	NC_007763	CGTCC	2	10	7877	7886	0 %	20 %	20 %	60 %	86359888
130	NC_007763	ATC	2	6	7895	7900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359888
131	NC_007763	TCG	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359888
132	NC_007763	GCC	2	6	8024	8029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359888
133	NC_007763	GAT	2	6	8032	8037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359888
134	NC_007763	TCG	3	9	8051	8059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359888
135	NC_007763	CGGC	2	8	8071	8078	0 %	0 %	50 %	50 %	86359888
136	NC_007763	TCT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359888
137	NC_007763	T	7	7	8145	8151	0 %	100 %	0 %	0 %	86359888
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169	NC_007763	GCCA	2	8	9183	9190	25 %	0 %	25 %	50 %	86359889
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177	NC_007763	TCG	2	6	9672	9677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359890
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179	NC_007763	TCT	2	6	9708	9713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359890
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242	NC_007763	GCCGG	2	10	12815	12824	0 %	0 %	60 %	40 %	86359893
243	NC_007763	CGT	2	6	12829	12834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359893
244	NC_007763	GCC	2	6	12836	12841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359893
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246	NC_007763	GGGC	2	8	12882	12889	0 %	0 %	75 %	25 %	86359893
247	NC_007763	GGA	2	6	12895	12900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359893
248	NC_007763	ATC	2	6	12902	12907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359893
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250	NC_007763	GAT	2	6	13009	13014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359893
251	NC_007763	GC	3	6	13029	13034	0 %	0 %	50 %	50 %	86359893
252	NC_007763	GGC	2	6	13040	13045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359893
253	NC_007763	CTG	2	6	13076	13081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359893
254	NC_007763	TGC	2	6	13098	13103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359893
255	NC_007763	CGA	2	6	13105	13110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359893
256	NC_007763	ATCTCG	2	12	13122	13133	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86359893
257	NC_007763	GCT	2	6	13180	13185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359893
258	NC_007763	CAA	2	6	13225	13230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359893
259	NC_007763	CCT	2	6	13260	13265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359893
260	NC_007763	AGC	3	9	13290	13298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359893
261	NC_007763	AGC	2	6	13314	13319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359893
262	NC_007763	CAG	2	6	13340	13345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359893
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264	NC_007763	GAA	2	6	13426	13431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359893
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